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Accueil > Bases > Ifremer.fr : un océan de ressources en sciences marines et aquatiques

Bases, Numéro de Juin 2008 - n°250


Ifremer.fr : un océan de ressources en sciences marines et aquatiques

Dans un précédent article consacré à l’organisme Sud-Africain NICS SA, (voir Bases n°234, janvier 2007), nous avions évoqué l’univers des ressources dans le domaine aquatique et maritime. Cette fois-ci, nous détaillerons les multiples ressources que l’Institut français de recherche pour l’exploitation de la mer (Ifremer) met gratuitement à la disposition du public sur son site www.ifremer.fr. (...)

Auteur : Carole Barthole

 
En 1985, L’Ifremer proposait déjà un accès à une dizaine de bases de données très spécialisées. On peut citer par exemple la base Neptune, qui recensait des mesures en séries temporelles effectuées en mer ou encore la base Biocean, qui inventoriait les prélèvements biologiques en eaux profondes par des laboratoires français.

Aujourd’hui, l’offre documentaire de l’Ifremer a considérablement évolué et s’est orientée vers des banques de données un peu moins spécialisées. Parmi ces bases, on recense :
- l’archive institutionnelle Archimer ;
- le “moissonneur” Avano ;
- une photothèque regroupant plus de 600 photographies ;
- plusieurs autres bases regroupant des données océanographiques et satellitaires.

Résolument inscrit dans le mouvement “Open Acess”, l’Ifremer lançait en août 2005 son archive institutionnelle Archimer, une base de textes intégraux permettant d’accéder gratuitement à des post-publications, des thèses, des actes de congrès et des rapports internes.
Un an plus tard, le “moissonneur” Avano voyait à son tour le jour. Un moissonneur se définit comme un outil permettant de collecter les données bibliographiques de plusieurs archives ouvertes et de les rassembler, afin de créer sa propre base de données.

On accède à ces deux ressources via la rubrique L’offre puis Services documentaires, disponibles depuis la page d’accueil.

ARCHIMER :  L’ARCHIVE OUVERTE DE L’IFREMER


A ce jour, Archimer donne accès à plus de 3 300 documents en texte intégral, dont la plupart sont des post-publications rédigées ou co-rédigées par l’Ifremer.
Ainsi, 56 % des documents sont des post-publications, 25 % sont des actes de congrès, 15 % des rapports et les 5 % restants des thèses.

Les domaines couverts par ces publications sont en principe nombreux, mais plus des 2/3 des documents disponibles relèvent des domaines de l’aquaculture et de la biologie. A titre d’exemple, on pourra trouver une thèse sur “La diversité et les différenciations génétiques des populations de tortues vertes du sud-ouest de l’Océan indien” ou une publication sur “La reproduction de l’huître creuse dans le bassin d’Arcachon en 2007”.

Différents types de recherche sont proposés :
- une recherche simplifiée ;
- une recherche par domaine ;
- une recherche avancée, qui offre des possibilités assez sophistiquées.

L’interface de recherche est disponible en anglais et en français, mais il est fortement conseillé d’effectuer sa requête avec des termes anglais car la plupart des documents ne sont rédigés qu’en langue anglaise.

La recherche peut s’effectuer dans le texte intégral, par titre, résumé, mots-clés, auteur, année de publication, DOI de publication, numéro d’enregistrement et type de document, avec bien sûr la possibilité de combiner tous ces critères.

L’utilisation des opérateurs booléens (AND, OR et ANDNOT) et la recherche par expression exacte est bien évidemment possible. 

Mais Archimer se démarque de la plupart des bases de données sur le Web car elle offre des fonctionnalités avancées, telles que la troncature à droite et, fait assez rare, la troncature à gauche, ainsi que l’opérateur de proximité NEAR (éloignement maximum de 5 mots sans ordre), la possibilité d’effectuer une recherche floue et de remplacer un caractère en milieu de mot.

AVANO : UN ACCES CENTRALISE A PLUS DE 140 000 RESSOURCES


Face à la prolifération des projets d’archives ouvertes, il devient aujourd’hui presque impossible de mener une recherche exhaustive dans chacune des archives disponibles. Avano propose donc une solution intéressante permettant un accès centralisé à plus de 140 000 références dans le domaine des sciences marines et aquatiques.

A l’heure actuelle, Avano moissonne 208 archives ouvertes  et les catalogues de 4 éditeurs commerciaux. Mais son principe d’indexation varie selon la couverture des archives.

Les ressources de 14 archives ouvertes spécialisées dans les sciences marines et aquatiques sont indexées en totalité (telles Aquatic Commons, Open Marine Archive ou encore Archimer), tandis que les archives concernant des domaines plus variés (telles ArXiv, Bioline International, Dspace at MIT…), ne sont indexées que pour leur contenu relatif au domaine.
Un lien Liste des Archives, proposé sur la page d’accueil, donne d’ailleurs un descriptif du contenu des différentes archives indexées et précise pour chacune le nombre de documents total et le nombre repris dans Avano.

La couverture est internationale et multilingue.
Parmi les nombreux documents, on retrouvera par exemple un acte de congrès sur la mortalité estivale des huîtres, un rapport sur la pêche de loisir dans le golfe du Morbihan ou encore une publication intitulée “Toxic effects of domestic sewage on zooplankton”.

Avano propose deux types de recherche : la recherche simplifiée ou avancée.

Comme pour Archimer, eu égard à la langue de la quasi-totalité des notices, il est recommandé d’effectuer sa recherche en anglais.

Les possibilités de recherche sont sensiblement les mêmes que pour Archimer, à la différence près que le nombre de champs est plus limité ; on dispose en effet des choix Tous les champs, Auteur, Titre, Nom de l’archive, Type de document et Période. Chaque notice propose ensuite un lien vers le texte intégral du document, sur le site de l’éditeur.

DES RESSOURCES INCONTOURNABLES EN SCIENCES MARINES ET AQUATIQUES


Afin de déterminer si les ressources proposées par l’Ifremer se démarquent réellement des documents disponibles sur les grands serveurs, nous avons décidé de sélectionner dans Avano une dizaine de documents très divers de par leur provenance, leur langue de rédaction et leur type. Nous les avons ensuite recherchés sur le serveur Dialog et sur Scirus. Le résultat est sans appel : un seul des documents sélectionnés était aussi disponible dans Dialog, tandis que quatre étaient recensés par Scirus.

Les ressources proposées par l’Ifremer se révèlent donc incontournables dans le cadre d’une recherche en sciences marines ou aquatiques.

Bien que les deux ressources soient toutes deux très intéressantes, il nous semble préférable d’utiliser directe-ment le moissonneur Avano, car il recense bien plus de documents que l’archive institutionnelle Archimer.
D’autant plus qu’Avano moissonne aussi les documents disponibles sur Archimer et propose directement un lien vers le texte intégral.

Au final, la clarté des interfaces et la valeur ajoutée des fonctionnalités font d’Avano et d’Archimer des outils particulièrement faciles et intéressants à utiliser.

www.ifremer.fr
Ifremer
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Tél : 33 (0)1 46 48 21 00
Fax : 33 (0)1 46 48 21 21



 

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