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Accueil > Bases > Stratégie proposée par Capadoc, représentant STN International

Bases, Numéro de Avril-Mai 2007 - n°237


Stratégie proposée par Capadoc, représentant STN International

Problématique 2 : Recherche de brevets relatifs au traitement du diabète ou de l’obésité, à partir d’une sous-structure chimique. La stratégie est effectuée sur le serveur STN, sur lequel sont interrogées les bases de données Chemical Abstracts (CAPLUS) et Derwent World Patents Index.

Auteur :

 

Les étapes de la recherche


1. Recherche de la structure chimique dans le fichier REGISTRY, répertoire de Chemical Abstracts Service de plus de 90 millions de substances ;

2. Transfert du résultat obtenu dans REGISTRY vers CAPLUS, banque de données de plus de 27 millions de références bibliographiques, de façon à retrouver uniquement les références de brevets concernant l’obésité ou le diabète ;

3. Interrogation de MARPAT, fichier de références de brevets possédant des formules génériques dites de Markush ;

4. Transfert du résultat obtenu dans MARPAT vers CAPLUS pour se limiter au sujet et élimination des doublons ;

5. Recherche de la structure dans le fichier Derwent Chemistry Resource de World Patents Index (1 million de substances et 15 millions de références de brevets), puis combinaison du résultat avec les notions de diabète ou d’obésité ;

6. Elimination des doublons entre les brevets obtenus via CAPLUS et WPINDEX ;

7. Classement des brevets par famille.

Stratégie sur STN International
                         
=> FIL REGISTRY

FILE 'REGISTRY' ENTERED AT 12:26:24 ON 26 APR 2007
COPYRIGHT (C) 2007 American Chemical Society (ACS)

=>  Uploading C:\STNEXP\Queries\STRUCTURE.str

Entrée dans REGISTRY
chargement de la structure prédessinée localement avec STN Express

L1      STRUCTURE UPLOADED


=> S L1
Test de la question sur un fichier échantillon

SAMPLE SEARCH INITIATED 12:26:44
SAMPLE SCREEN SEARCH COMPLETED -     2111 TO ITERATE

 94.7%                 PROCESSED             2000 ITERATIONS                           
 50 ANSWERS
SEARCH TIME: 00.00.01

FULL FILE PROJECTIONS:  ONLINE  **COMPLETE**
                                      BATCH   **COMPLETE**
PROJECTED ITERATIONS:        39464   TO    44976
PROJECTED ANSWERS:             2524   TO      4062

L2           50 SEA SSS SAM L1


=> D SCAN
Visualisation d’une réponse en format SCAN gratuit

L3       3440 ANSWERS   REGISTRY  COPYRIGHT 2007 ACS on STN
IN       1H-Pyrazole-3-carboxamide, 5-(4-chlorophenyl)-1-(2,4-dichlorophenyl)-N-1-piperidinyl-,
            hydrochloride (1:1)
MF       C21 H19 Cl3 N4 O . Cl H
 
HOW MANY MORE ANSWERS DO YOU WISH TO SCAN? (1):0
  
Recherche de la sous-structure sur l’intégralité de REGISTRY (90 M de substances)
 Résultat : 3 440 substances

=> S L1 FUL
FULL SEARCH INITIATED 12:26:55
FULL SCREEN SEARCH COMPLETED -    42337 TO ITERATE

100.0% PROCESSED    42337 ITERATIONS                          3440 ANSWERS
SEARCH TIME: 00.00.01

L3         3440 SEA SSS FUL L1


=> FIL CAPLUS
Entrée dans CAPLUS
Transfert des 3 440 RN (Registry Numbers) CAS que l’on combine avec les notions d’obésité
ou de diabète d’une part, et avec le type de document brevet d’autre part (P/DT)

Résultat : 89 références de brevets

FILE 'CAPLUS' ENTERED AT 12:28:41 ON 26 APR 2007
COPYRIGHT (C) 2007 AMERICAN CHEMICAL SOCIETY (ACS)

=> S L3 AND (OBESITY+ALL/CT OR DIABETES+ALL/CT OR ?OBES? OR ?DIABET?) AND P/DT
    813    L3
    306813    OBESITY+ALL/CT  (21 TERMS)
         92789     DIABETES+ALL/CT  (3 TERMS)
        201557     ?OBES?
        148659     ?DIABET?
       5681939     P/DT
L4            89     L3 AND (OBESITY+ALL/CT OR DIABETES+ALL/CT OR ?OBES? OR ?DIABET?) AND P/DT


=> FIL MARPAT
Entrée dans MARPAT et recherche de la structure L1
Résultat : 234 références de brevets ayant une structure générique correspondant à la question

FILE 'MARPAT' ENTERED AT 12:28:56 ON 26 APR 2007
COPYRIGHT (C) 2007 American Chemical Society (ACS)

=> S L1 FUL
FULL SEARCH INITIATED 12:29:04
FULL SCREEN SEARCH COMPLETED -     5656 TO ITERATE

100.0%      PROCESSED           5656 ITERATIONS                 234 ANSWERS
SEARCH TIME: 00.00.03

L5          234 SEA SSS FUL L1


=> FIL CAPLUS
Entrée dans CA PLUS.
Transfert des 234 réponses MARPAT pour leur associer les notions d’obésité ou de diabète.
Résultat : 44 références que l’on  combine avec les 89 retrouvées initialement.
Total : 106 références de brevets.

FILE 'CAPLUS' ENTERED AT 12:29:18 ON 26 APR 2007
COPYRIGHT (C) 2007 AMERICAN CHEMICAL SOCIETY (ACS)

=> S L5 AND (OBESITY+ALL/CT OR DIABETES+ALL/CT OR ?OBES? OR ?DIABET?)
    235    L5
    306813    OBESITY+ALL/CT  (21 TERMS)
             92789    DIABETES+ALL/CT  (3 TERMS)
            201557    ?OBES?
        148659     ?DIABET?
L6              44     L5 AND (OBESITY+ALL/CT OR DIABETES+ALL/CT OR ?OBES? OR ?DIABET?)

=> S L4 OR L6
L7         106         L4 OR L6


=> FIL WPINDEX

Entrée dans World Patents Index. 
 Recherche de la structure L1
 Résultat : 414 substances

FILE 'WPINDEX' ENTERED AT 12:30:17 ON 26 APR 2007
COPYRIGHT (C) 2007 THE THOMSON CORPORATION

=> S L1 FUL
FULL SEARCH INITIATED 12:30:23
FULL SCREEN SEARCH COMPLETED -     2944 TO ITERATE

100.0% PROCESSED       2944 ITERATIONS                       414 ANSWERS
SEARCH TIME: 00.00.07

L8          414 SEA SSS FUL L1

=> D SCAN
 Affichage d’une substance en format SCAN gratuit

L8  414  ANSWERS  WPINDEX        COPYRIGHT 2007 THE THOMSON CORP on STN
     
CN.S     5-(4-Chloro-phenyl)-1-(2,4-dichloro-phenyl)-4-(2H-tetrazol-5-ylmethyl)-1H-
         pyrazole-3-carboxylic acid pyridin-4-ylamide
MF       C23 H15 Cl3 N8 O
    
HOW MANY MORE ANSWERS DO YOU WISH TO SCAN? (1):0
 
Recherche des références comportant à la fois l’une des 414 structures et la notion
d’obésité ou de diabète dans les champs USES ou ADVANTAGE ;
utilisation des troncatures gauche et droite.

 Résultat : 77 références

=> S L8/DCR AND (?OBES? OR ?DIABET?)/UADV,USE,ADV
               108     L8/DCR
              2611     ?OBES?/UADV           
             22174     ?OBES?/USE            
              7203     ?OBES?/ADV            
              2266     ?DIABET?/UADV           
             34756     ?DIABET?/USE            
              2205     ?DIABET?/ADV            
L9              77     L8/DCR AND (?OBES? OR ?DIABET?)/UADV,USE,ADV

=>  DUP REM L7 L9
   
Elimination des doublons CAPLUS/WPINDEX
 La comparaison se fait sur les brevets  “basiques” via le champ PN (n° de brevet).
 47 doublons ont été repérés. Il peut  toutefois en subsister si CAPLUS et  WPINDEX n’ont pas pris le même brevet basique dans une famille.

FILES 'CAPLUS, WPINDEX' ENTERED AT 12:31:37 ON 26 APR 2007
ALL COPYRIGHTS AND RESTRICTIONS APPLY.  SEE HELP USAGETERMS FOR DETAILS.

2 FILES IN THE FILE LIST
PROCESSING COMPLETED FOR L7 

PROCESSING COMPLETED FOR L9 
L10            136       DUP REM L7 L9 (47 DUPLICATES REMOVED)
                            ANSWERS '1-106' FROM FILE CAPLUS     
                            ANSWERS '107-136' FROM FILE WPINDEX    



=> FSORT L10

D’où l’utilisation de la commande FSORT pour regrouper les brevets d’une même famille.
 12 familles sont repérées.

SEL L10 1- PN,APPS
L11         SEL L10 1- PN APPS :    1268 TERMS

'L11' DELETED
L11         136 FSO L10

             12 Multi-record Families   Answers 1-29
                  Family 1                  Answers 1-2
                  Family 2                    Answers 3-4
                  Family 3                    Answers 5-6
                  Family 4                    Answers 7-10
                  Family 5                    Answers 11-12
                  Family 6                    Answers 13-16
                  Family 7                    Answers 17-18
                  Family 8                    Answers 19-20
                  Family 9                    Answers 21-22
                  Family 10                   Answers 23-24
                  Family 11                   Answers 25-27
                  Family 12                   Answers 28-29
            107 Individual Records          Answers 30-136
              0 Non-patent Records     
                                                                                                                                   
Résultat : 136 références de brevets  dont 12 familles, ce qui revient à un total de 119 brevets distincts.


CONCLUSION :


en associant recherche structurale et recherche thématique, à la fois dans les banques de données de Chemical Abstracts Service et de Derwent, cette stratégie a permis de retrouver 119 références distinctes de brevets, qu’il aurait été difficile de repérer via d’autres techniques.

 

Bases 237_STN.2

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